微生物多样性检测(Microbial diversity)
环境微生物多样性检测,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究,通过对核糖体RNA高变区域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)进行PCR扩增和测序,然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律。
基因组重测序(Re-sequencing)
使用的Illumina Genome Analyzer平台只需要极少量的样品,便可对数量有限的保存组织、拟胚体、小的模式系统和难以培养的生物进行测序。
全外显子测序
全外显子组测序WES(Whole Exome Sequencing)是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域 DNA 富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。
动植物基因组测序(de novo测序 进化分析 基因组图谱)
动植物基因组de novo测序也叫做基因组从头测序,是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序,然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装,最终获得该物种基因组序列图谱。
细菌基因组测序
新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间,让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求,细菌基因组测序可分为四种类型:细菌基因组Scanning、细菌基因组
二代测序
环境样品的宏基因组鉴定 微生物基因组测序 病原体检测 人类目标序列重测序 扩增子直接克隆测序(PCR产物) 传染病源快速鉴定 转录组研究 肿瘤基因组和突变
微生物Meta测序
16S rDNA序列(在所用物种中高度保守)是最常用的细菌分类标准,通过提取环境样品的DNA,并扩增其中16S rDNA基因;通过检测16S rDNA 的序列变异和丰度,反映环境样本中细菌的分类和丰度